PubMedAgent · 生物文献OpenManus 🧬⚡

医学界的Manus Agent - 当Manus在多模态领域大放异彩时，PubMedAgent正以生物医学文献智能体的身份掀起科研革命！

🌟 核心功能

🔍 文献智能检索

• 自然语言查询解析（示例："肺癌的免疫治疗进展"）
• 多条件结果过滤（年份/期刊/研究类型）
• 关键信息摘要生成

🧠 核心架构解析

# 典型Agent工作流（src/main.py 核心逻辑）
async def generate():
    async for event in agent.aquery(user_input):
        if event.type == "thinking":
            yield render_thought(event.content)  # 思考过程可视化
        elif event.type == "observation":
            yield render_data(event.content)     # 原始数据展示
        elif event.type == "final":
            yield render_answer(event.content)   # 最终答案生成

架构优势

1. 模块化设计

   src/
   ├── agents/      # Agent核心逻辑
   ├── tools/       # PubMed等工具集成
   ├── prompts/     # 提示工程模板
   └── utils/       # 配置与辅助函数

2. 实时流处理
   基于Quart的Server-Sent Events实现：

   @app.route('/query', methods=['POST'])
   async def query():
       async def generate():
           async for event in agent.aquery(user_input):
               yield f"data: {json.dumps(event)}\n\n"

3. 认知可追溯

   graph LR
   A[用户问题] --> B(意图识别)
   B --> C{问题类型}
   C -->|文献查询| D[PubMed工具]
   C -->|概念解析| E[LLM推理]
   D --> F[结果增强]
   E --> G[知识图谱]
   F & G --> H[结构化输出]
   

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🚀 快速开始

1. 基础部署

# 克隆仓库
git clone https://github.com/AceLi12138/PubMedAgent.git

# 安装依赖
pip install -r requirements.txt

# 启动服务（开发模式）
python src/main.py --debug

2. 高级配置

# config.py 核心配置项
CONFIG = {
    "max_iterations": 5,          # Agent最大推理轮次
    "result_cache_ttl": 3600,     # 结果缓存时间
    "enable_debug": False,        # 调试模式
    "api_timeout": 30.0           # API超时设置
}

🌐 界面技术解析

1. 赛博朋克视觉设计

/* 矩阵背景动画 */
@keyframes matrix {
    0% { background-position: 0 0; }
    100% { background-position: 0 100%; }
}

/* 霓虹光效文本 */
.glow-text {
    text-shadow: 0 0 10px #0ff;
    animation: glow 2s ease-in-out infinite;
}

/* 全息投影效果 */
.hologram {
    background: radial-gradient(circle, #0ff 0%, transparent 70%);
    animation: hologram-pulse 2s ease-in-out infinite;
}

• 动态矩阵背景使用CSS渐变+Base64图案实现
• 消息框采用玻璃拟态效果(backdrop-filter: blur(10px))
• 三维立方体按钮使用CSS 3D变换

2. 实时交互系统

// 基于SSE的事件处理
const eventSource = new EventSource('/query');
eventSource.onmessage = (e) => {
    const data = JSON.parse(e.data);
    switch(data.type) {
        case 'thinking':
            renderThinkingProcess(data.content);
            break;
        case 'observation':
            renderDataVisualization(data.content);
            break;
        case 'final':
            renderFinalAnswer(data.content);
    }
};

// Markdown动态渲染
function renderMarkdown(content) {
    const html = marked.parse(content);
    const container = document.createElement('div');
    container.className = 'markdown-content';
    container.innerHTML = html;
    hljs.highlightAllUnder(container);
    return container;
}

3. 核心交互功能

功能	实现技术	关键代码文件
动态输入框	CSS Transition + JS ResizeObserver	style.css/chat.js
能量条反馈	CSS Gradient + JS Input事件	style.css#L450
消息动画系统	CSS Keyframes + requestAnimationFrame	style.css#L120
代码高亮	highlight.js + marked	chat.js#L45

4. 响应式设计

@media (max-width: 768px) {
    .chat-container {
        height: 100vh;
        border-radius: 0;
    }
    
    .message-content {
        max-width: 90%;
        padding: 10px;
    }
    
    .cyber-button {
        width: 40px;
        height: 40px;
    }
}

• 移动端优先的响应式布局
• 触摸友好的交互元素尺寸
• 折叠式调试信息面板

5. 创新交互元素

// 三维立方体加载动画
class CubeLoader {
    constructor() {
        this.cube = document.createElement('div');
        this.cube.className = 'cube-loader';
        // 创建6个面并应用3D变换
    }
    
    start() {
        this.cube.style.animation = 'cube-spin 4s linear infinite';
    }
}

// 能量条动态反馈
class EnergyBar {
    constructor() {
        this.bar = document.querySelector('.energy-fill');
        this.maxLength = 1000;
    }
    
    update(value) {
        const percent = Math.min((value.length / this.maxLength) * 100, 100);
        this.bar.style.width = `${percent}%`;
    }
}

📜 开源协议

本项目采用 MIT License，您可以在保留版权声明的前提下自由使用、修改和分发代码。

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